Après des études à la faculté de Paris-VI, Marianne Fonck-Frayssinet obtient son doctorat en médecine à Bordeaux en 1992. Parallèlement à un internat spécialisé consacré aux maladies de l’appareil digestif, elle entreprend une maitrise puis un DEA consacré à l’application du  concept des réseaux neuronaux à la détermination de facteurs pronostiques dans le cancer de l’estomac. Après un clinicat d’hépatogastroentérologie, elle décide de se consacrer exclusivement à la cancérologie digestive et rejoint l’Institut Bergonié en 1999. Elle obtient alors un Master spécialisé en Management par la Qualité en 2004.

Le Dr Fonck assure avec ses collègues la prise en charge médicale des tumeurs de l’appareil digestif (Voir chapitre Traitements). Elle est investigatrice de nombreux essais cliniques. Ses deux domaines d’intérêt particulier sont l’oncogériatrie et la chronicisation de la maladie métastatique colorectale notamment en collaboration avec le Dr Palussière, en combinant chimiothérapies et ablations percutanées de cibles résiduelles. Elle participe aux deux RCP hebdomadaires du Groupe Digestif. Elle est membre correspondante du Réseau ENETS dédié aux tumeurs neuro-endocrines.